Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CLN3Q13286 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms