Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM28Q13263 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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