Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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