Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SLC10A2Q12908 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms