Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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EFEMP1Q12805 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFEMP1Q12805 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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