Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSRP1Q08945 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms