Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CYP4F3Q08477 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CYP4F3Q08477 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms