Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC073911.2-201ENST00000624989 468 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC026725.1-201ENST00000511327 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms