Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN1Q04323 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms