Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms