Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL23P55773 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL23P55773 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms