Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGA8P53708 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms