Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF135P52742 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms