Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms