Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LHX1P48742 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX1P48742 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms