Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER3P43115 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms