Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GDF5P43026 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GDF5P43026 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GDF5P43026 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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GDF5P43026 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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