Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms