Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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