Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms