Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms