Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMNB1P20700 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMNB1P20700 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms