Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTPS1P17812 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTPS1P17812 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms