Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CKMT2P17540 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CKMT2P17540 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CKMT2P17540 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms