Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA4P13612 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms