Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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HOXD8P13378 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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HOXD8P13378 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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HOXD8P13378 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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