Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms