Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13BP05160 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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