Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PF4P02776 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PF4P02776 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PF4P02776 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PF4P02776 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PF4P02776 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PF4P02776 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PF4P02776 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PF4P02776 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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