Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms