Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PDE6DO43924 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6DO43924 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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