Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA2O00451 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms