Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC01387J3KSC0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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