Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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