Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA1C9JL84 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms