Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms