Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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