Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID3CA6NKF2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms