Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCAF1Q9Y4B6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms