Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms