Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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