Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms