Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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COPS7AQ9UBW8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
COPS7AQ9UBW8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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