Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DKK3Q9UBP4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms