Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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