Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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