Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYLDQ9NQC7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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