Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP29Q9HBJ7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms