Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C11orf49Q9H6J7 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms