Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF6Q9BYE7 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms